তিনি ২০২১ সালের ২৬ জানুয়ারি রাজশাহীর বিভাগীয় কমিশনারের দায়িত্ব পালনকালে সচিব পদোন্নতি পেয়ে নির্বাচন কমিশন সচিবালয়ে যোগদান করেন। গত বছরের ১ নভেম্বর তাকে বদলি করে তথ্য ও সম্প্রচার মন্ত্রণালয়ে দায়িত্ব দেয় সরকার।
বিসিএস প্রশাসন ক্যাডারের ১০ম ব্যাচের কর্মকর্তা হুমায়ুন কবীর খোন্দকার ১৯৯১ সালে বাংলাদেশ সিভিল সার্ভিসে যোগদান করেন। কর্মজীবনে তিনি সহকারী কমিশনার, প্রথম শ্রেণির ম্যাজিস্ট্রেট, উপজেলা নির্বাহী অফিসার, অতিরিক্ত জেলা প্রশাসক, ক্যান্টনমেন্ট এক্সিকিউটিভ অফিসার, জেলা প্রশাসক এবং বিভাগীয় কমিশনার হিসেবে মাঠ প্রশাসনে কাজ করেছেন। ২০১৪ সালে তথ্য ও যোগাযোগ প্রযুক্তি পদক এবং ২০১৬ সালে জনপ্রশাসন পদক লাভ করেন হুমায়ুন কবীর খোন্দকার।
